崔琦因发现“分数量子霍尔效应”而与德国科学家霍斯特・斯托尔默和美国科学家罗伯特・劳克林共同获得1998年诺贝尔物理学奖.他是继杨振宁、李政道、丁肇中、李远哲、朱棣文之后获得诺贝尔奖的第六位美籍华裔科学家.
霍尔效应是美国物理学家霍尔于1879年在研究金属的导电机构时发现的.当电流垂直于外磁场通过导体时，在导体的垂直于磁场和电流方向的两个端面之间会出现电势差，这一现象便是霍尔效应.这个电势差也被叫做霍尔电势差.量子霍尔效应是霍尔效应的量子力学版本.一般被看作是整数量子霍尔效应和分数量子霍尔效应的统称.整数量子霍尔效应被马普所的德国物理学家冯・克利青发现.他因此获得1985年诺贝尔物理学奖.分数量子霍尔效应被崔琦、施特默和赫萨德（A.C.Gossard）发现.整数量子霍尔效应最初在高磁场下的二维电子气中被观测到；分数量子霍尔效应通常在迁移率更高的二维电子气下才能被观测到.2004年，英国曼彻斯特大学物理学家安德烈・海姆和康斯坦丁・诺沃肖洛夫成功地在实验中从石墨中分离出石墨烯，在常温下观察到量子霍尔效应.一些理论学家指出分数量子霍尔效应中的某些平台可以构成非阿贝尔态（Non-Abelian States），这可以成为搭建拓扑量子计算机的基础.
1939年2月28日，崔琦出生在中国河南省平顶山市宝丰县肖旗乡范庄村一个农民家庭.1949年，崔琦在新宝镇的石桥区高皇庙上完小学，其实当时他在这个小学接受的也就是私塾般的四书、五经教育.由于当地没有中学，崔琦只好辍学在家.他具有典型农村孩子的那种朴实和勤劳，稍大一点就帮家里干活.在他十三四岁时因为能写会算，村里把他抽去跟着分地，无论三角形、菱形、梯形地都难不住他.当时有个方圆几十里有名的老会计，故意找了一块外号“一杆旗”的地块（相当于不规则三角形）难为他.等各个边的数据一测出，崔琦一口就说出结果来，惊得大伙儿直吐舌头.土改时他还参加演出村里排的戏剧《血泪仇》，演得特别像，把满院子看戏的人都引哭了.当人们争着夸崔琦聪明、能干时，崔琦却十分谦虚地笑着说我还差得远，希望乡亲们不要这样夸我.
1951年，在舅舅和此前两年已在香港定居的二姐崔珂的帮助下，崔琦抵达香港，直接进入六年级学习.在香港，崔琦面临的最大困难是语言关，一是学说广东话，二是学好英文．后来，他进入培正中学就读，这使他的英文进步很快，因为这是一所双语并用的学校，课本用中文，授课用英语或是名词中英对照，这种教学方式使崔琦受益匪浅．他后来回忆认为：“华人研读科学应该中英文交错使用，才可兼容并蓄，收到真正学习之效．”他说，只懂得中文会令科学家无法追读最新的科研报告，而完全放弃中文却是舍本逐末．崔琦在香港读书期间，因为语言交流不便及生活艰难等诸多原因，强烈思念在家乡的母亲，两次写信给母亲要求回老家.母亲收到信后，通过别人告诉崔琦不要想家，好好读书求学才是对父母亲最大的安慰.崔琦刻苦攻读，靠全额奖学金完成中学学业.1958年19岁的崔琦获得美国全额资助，只身横渡太平洋，前往美国伊利诺依州奥古斯塔纳学院就读.这时，他的父亲崔长生已身患重病，卧床不起.作为唯一的儿子，崔琦本应回国为父尽孝，但母亲却始终对他隐瞒了这件事，直到1959年夏天父亲去世，母亲都没对他透露一点儿消息.在这之后的9年间，母亲不管自己受多大的罪，都没有影响儿子的学业.
为了进一步深造，他又来到芝加哥大学师从史达克教授，在这里，史达克教授风趣的物理教学及物理学广博的奥妙，使崔琦对物理学产生了特别的喜好，并开始对物理学研究投入更多的精力.当他圆满完成这里的学业后，又前往贝尔研究室跟随罗威尔教授学习研究，这里的物理实验更使他趣味盎然，并决心投身于物理学的研究与探索．1967年，崔琦在芝加哥大学获得物理学博士学位；1982年任新泽西州普林斯顿大学电子工程系教授；1984年当选美国科学院院士，成为美国物理学会、美国高尖科学学会会员，并获浓缩物质物理巴克利奖；1998年获本杰明・富兰克林物理奖.
崔琦一方面治学严谨、专心致志，对自己钟爱的物理学研究事业非常投入，有时为了实验研究的需要，他不惜四处奔波，走遍波士顿及佛罗里达州，就为了找个强力磁场以进行他的“量子液体实验”，并且工作时很少理会身旁其他事情，以致他的研究工作非常出色、非常有效率．而另一方面，崔琦又是一个很具幽默感、很随和的人，他常视物理实验如玩游戏，他说，能随心所欲设计新模型，能制造一个个用钱都买不到的新产品，那种满足感难以形容，做实验又有何难？在研究中遇到困难时，他也会说：“外面天气很好，到外面玩玩再回来，不要压着自己钻进牛角尖，松弛一下，将会更有利于问题的解决．”
普通而又平凡的出身，坎坷的境遇，严格的家规，传统的教育，重教的家庭，造就了一个朴实、温顺、勤奋、聪慧、坚韧的崔琦.
崔琦还是一个兴趣广泛、全面发展的人．他对很多事物均感兴趣．当年，他不仅物理、生物、化学、中英文等学科成绩都特别好，而且他还喜爱打篮球和唱歌．大学毕业时，有同学对崔琦如下评价：“六尺身材堪谓高，天赋英聪功课好，兼长国、英、数，日常小事却糊涂，五毫当一毫．写字时笔墨飞舞，笔迹字体犹如乱草，指挥音乐，南拳北腿如比武，歌声动人，姿势美妙够风度……”他还有一大爱好就是周末数小时的阅报，从不间断，无论是政治、科技，还是经济、艺术、体育，他都不放过．崔琦因此还幽默地说：自己什么新闻都爱看，但不是所有的都看得懂．也正是广泛的兴趣和宽阔的知识面，使他思维活跃，脑中经常涌现新想法、新念头．
2003年11月，中国科学院物理研究所正式授予崔琦“中国科学院物理研究所讲座教授”荣誉称号，并商定设立“崔琦讲座”，即每年请崔琦教授在世界范围内邀请一名诺贝尔奖获得者或世界一流的物理学家在物理所进行短期访问和学术交流，同时对物理所的研究工作进行指导和评估.崔琦教授非常愉快地接受了这一荣誉，并表示今后会更加关心物理所的发展，为培养一批杰出的中国青年物理人才尽更大努力.